在光学显微镜下可见到两种大小、形态结构不同的颗粒衣原体。较小的称原（Elementary body），直径约为0.3um。卵圆形，电子密度大，是衣原体有感染性的形态。较大的称为始体 (initial body)直径约为0.5～0.3um,呈圆形或不规则形，电子密度较小，是衣原体的无感染性形态。但有人认为还存在着一种过渡形态，即中间体 (Intermediate body)，亦有人把始体称为网状体(Reticulate bod
衣原体的生活周期
    衣原体有其独特的生活周期，种间无差异。原体在宿主细胞外较为稳定，但具有高度的感染性。当与易感细胞接触时，以吞饮的方式进入细胞内，由宿主细胞膜包围原体而形成空泡，在空泡内的原体增大，发育成为始体。始体在空泡以二分裂形式繁殖，在空泡内形成众多的子代原体，构成各种形态的包涵体（Inclusion body）。包涵体的形态、在细胞内存在的位置、染色性等特征，有鉴别衣原体的意义。成熟的子代原体从宿主细胞释放出来，再感染其他的宿主细胞，开始新的发育周期。每个发育周期约需40小时。始体是衣原体周期中的繁殖型，而不具有感染性。