女性尿道炎的合并症有以下几种：
      (1)急性盆腔炎或慢性盆腔炎
      急性盆腔炎表现为发烧、头痛、食欲不振和下腹部疼痛，可伴有腹胀、恶心和呕吐等消化道症状。下腹部有压痛和反跳痛(即用手下压后突然抬起时痛感加重)，下腹部两侧可扪到肿物。慢性盆腔炎时全身症状不明显，主要表现为腰酸、白带增多、下腹部坠胀感和疼痛。有时伴月经不调。子宫内膜炎时会出现月经量增多、经期延长或缩短和下腹部钝痛等症状。反复发作可导致不孕、异位妊娠(宫外孕)、绒毛膜羊膜炎、流产、早产和死胎等。
      (2)前庭大腺炎
      在小阴唇和处女膜间的前庭大腺开口处出现潮红、水肿和局部疼痛，严重时可出现脓肿，慢性反复发作可形成囊肿，可触及肿大的腺管及腺体。
      (3)肝周炎
      肝周炎是由沙眼衣原体引起的肝脏表面和邻近腹膜的局限性纤维性炎症，引起肝和膈肌黏连，致使右上腹疼痛，临床上表现为发烧、盆腔痛和肝区(右上腹)痛。
      (4)新生儿感染
      母亲有衣原体感染，约有30％～50％的新生儿经过产道时可发生眼部感染，潜伏期比淋菌性结膜炎长，约于生后3～13天出现，表现为眼部黏液脓性分泌物，多不侵犯角膜，如不及时治疗可转变成慢性感染。生后2～3周可发生肺炎，大多在6周时才确诊。表现为呼吸急促，断续咳嗽，不发烧，喘鸣少见，两肺弥漫性罗音，X线见肺高度膨胀，间质浸润。从结膜、鼻咽、气管分泌物中可分离出D～K型沙眼衣原体。
      研究发现，宫颈解尿支原体感染的妇女分娩出婴儿的平均体重低于无感染的妇女，用红霉素治疗支原体感染的孕妇可降低低出生体重儿的发生率。